A Diretoria da Faculdade de Engenharia Mecânica é composta pelo Diretor e Diretor Associado com mandato de quatro anos, indicados em uma consulta interna com participação ponderada de docentes, funcionários e discentes. A direção executiva da FEM é exercida por seu Diretor, com auxílio direto do Diretor Associado, do Assistente Técnico da Unidade (ATU) e pela Secretária da Diretoria.
Diretor: Prof. Dr. Alberto Luiz Serpa
Diretor Associado: Prof. Dr. Waldyr Luiz Ribeiro Gallo
Assistente Técnico da Unidade(ATU): Gerson Alcaraz Gamis
Secretária da Diretoria - Fatima Sueli Simões Lima